解卷积插件提升线粒体拍摄清晰度效果还不错
#科学回音壁 #线粒体 今天在网上搜索了一下Fiji/Image J的开源解卷积插件，虽然说是用于共聚焦拍摄的3D图片，但我试了下也可以用于其他显微镜的2D图片。可以对图片去模糊，提升清晰度和分辨率。\n需要用到两个插件，两个插件都直接下载到Fiji/Image J的Plugins文件夹下，不要解压缩。\n扩散函数PSF下载网址如下：https://bigwww.epfl.ch/algorithms/psfgenerator/ ，PSF可以为图像解卷积处理提供必要的PSF模型，解卷积算法需要通过PSF来逆向还原被模糊的图像细节，而其中参数是根据你拍摄显微镜图片的参数来进行调整的。\n DeconvolutionLab2插件主要用途是对光学显微镜图像进行去模糊处理，提升图像的分辨率和清晰度，下载网址如下： https://bigwww.epfl.ch/deconvolution/deconvolutionlab2/\n两个插件下载后，首先点击Fiji/ImageJ–Plugins–PSF Generator–Optimal Model设置PSF模型参数，其中Wavelength是所拍摄图片用到的激光器波长，一般是405/488/561/638 ，NA是显微镜镜头的数值孔径值，XYZ轴像素分辨率根据所拍摄显微镜来来设置，图片大小等根据自己所拍摄图片来，设置后点击Run，这里需要一定运行内存，将运算出来的PSF模型存储为图片。\n点击Plugins–DeconvolutionLab2–将自己想要处理的图输入Image，上步运算的PSF模型输入第二个PSF，算法可以选择文献中所用的Richardson-Lucy，选择后点击Run运行，就会出来经过解卷积去模糊处理的图片啦。\n \n一般共聚焦会有自己的解卷积处理软件，如果大家拍摄的荧光显微镜没有比较合适的解卷积处理软件，就可以用这款开源插件来进行分析。我用的图片拍摄来自于联华智造的宽场显微镜，荧光显微镜也可以拍摄出共聚焦显微镜才能拍摄的线粒体的效果，拍摄后原图直出和解卷积处理后对比，可以看到清晰度的提升。\n#科研 #软件分享 #科研学习 #科研绘图 #研究生学习 #智能荧光显微分析仪