🔥用 R 秒提 GEO 临床信息！速来白嫖✨
GEO临床信息提取脚本 R 软件使用教程\n一、准备工作\n安装 R 软件\n请确保已安装 R，并建议使用 RStudio 以获得更好的操作体验。\n准备数据文件\n将目标 GEO 数据集的 xxx_series_matrix.txt 文件和 extract_geo_clinical.R 脚本放在同一文件夹下。\n二、参数修改\n在 R 脚本中，主要需要修改以下参数：\n数据文件名\nApply to extract_geo_…\nfile_path <- \”GSE41847_series_matrix.txt\”\n修改为你要处理的 GEO 文件名，如 \”GSE32915_series_matrix.txt\”。\n输出文件名（可选）\nApply to extract_geo_…\nwrite.csv(clinical_df, \”Clinical_info.csv\”, row.names = FALSE)\n如需自定义输出文件名，可修改 \”Clinical_info.csv\”。\n三、运行步骤\n打开 R 软件\n启动 R 或 RStudio。\n设置工作目录\n在 R 控制台输入（将路径替换为你的文件夹路径）：\nApply to extract_geo_…\nsetwd(\”你的文件夹路径\”)\n例如：\nApply to extract_geo_…\nsetwd(\”C:/Users/你的用户名/Desktop/8 GEO临床信息提取\”)\n打开并运行脚本\n在 RStudio 中，点击“文件”->“打开文件”，选择 extract_geo_clinical.R。\n点击“源”按钮（或 Ctrl+Shift+Enter）运行整个脚本。\n查看结果\n脚本运行结束后，当前文件夹下会生成 Clinical_info.csv 文件。\n可用 Excel 或 R 读取查看：\nApply to extract_geo_…\nclinical <- read.csv(\”Clinical_info.csv\”)\nhead(clinical)\n#GEO数据库 #临床数据 #GEO数据 #GEO数据分析 #GEO数据挖掘 #R语言辅导 #R语言数据分析